AFS技術(shù)
聲學(xué)力譜(AFS),是一種用于高度并行操縱單分子的方法。AFS單分子聲力譜儀是**款商業(yè)化的獨(dú)立儀器,包括一個(gè)易于操作和測量的智能化專業(yè)顯
微鏡。AFS技術(shù)是采用功能強(qiáng)大而成本低廉的芯片裝置,能夠高精度施加力同時(shí)對數(shù)千個(gè)的生物分子進(jìn)行檢測。
原理
AFS技術(shù)由玻璃微流控芯片和透明的壓電變換器構(gòu)成來產(chǎn)生共振聲波。AFS芯片上的聲波(超聲波)可同時(shí)并行地在數(shù)千個(gè)生物分子(如DNA,RNA或蛋白
質(zhì))施加亞皮牛頓(pn)到數(shù)百皮牛頓(pn)的力,同時(shí)具有亞毫秒的響應(yīng)時(shí)間及固有穩(wěn)定性。
AFS作為一個(gè)理想的工具在核酸蛋白、**蛋白和抗原抗體層面上破譯分子間相互作用的詳情。AFS技術(shù)能夠使科學(xué)家研究蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能相互關(guān)
系,新的生物機(jī)制和細(xì)胞力學(xué),也可用于研究和識(shí)別自由能圖,動(dòng)力學(xué)速率和在反應(yīng)過程中的中間態(tài)。
AFS作為一個(gè)高度集成化的系統(tǒng),包括倒置光學(xué)顯微鏡與軟件、工作站及相關(guān)電子器件,用戶界面友好,操控方便。
主要技術(shù)特點(diǎn)
AFS的多功能設(shè)計(jì)
AFS作為一個(gè)高度靈活的單分子檢測儀器,其顯微鏡平臺(tái)給用戶定制和個(gè)性化需求提供了多重選擇。
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通過在200毫米、150毫米、75毫米和50毫米不同鏡筒透鏡安裝距離來改變光學(xué)放大倍數(shù)
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可拆卸側(cè)板便于對光學(xué)路徑的簡單調(diào)整
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標(biāo)準(zhǔn)25毫米網(wǎng)格便于外部安裝射流功能的組件(如注射泵)
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特殊設(shè)計(jì)能夠快速簡單連接外部放大器
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專用芯片底座能夠使射流和電子連接**地接到AFS芯片、簡單快速地固定或重新固定
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滑動(dòng)裝置用于準(zhǔn)確定位和鎖定物鏡上的樣品
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配裝夾具以確保工作臺(tái)上流體組件的固定,以便實(shí)現(xiàn)多種流動(dòng)形式,如重力或注射器驅(qū)動(dòng)的流動(dòng)
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AFS的應(yīng)用
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動(dòng)態(tài)力譜
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恒力測試
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力-距離曲線
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生物聚合物力學(xué)
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鍵斷裂
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微流變學(xué)
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細(xì)胞力學(xué)
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水凝膠力學(xué)性能
高精度力學(xué)及長度測量
AFS是對單個(gè)生物分子進(jìn)行高精度力學(xué)測量的理想工具。我們在此通過對單個(gè)DNA分子不同張力程度及使用AFS的跟蹤軟件測量其長度來證明AFS的高測量精度。
本實(shí)驗(yàn)是在被拴在鏈霉親和素包裹的聚苯乙烯微球(直徑4.5μm)上的單個(gè)DNA分子(長度8.4 kbps)上進(jìn)行的。
用測量之前已生成的對照表來跟蹤微球的高度可達(dá)納米精度。
測量過程中,我們將驅(qū)動(dòng)電壓的(正負(fù)峰間)幅度從0 Vpp增加到2.1 Vpp,相應(yīng)的聲學(xué)力從0 pN增加到15.8 pN。AFS軟件能實(shí)時(shí)確定在各種力作用下的DNA長度,以此來探測生物活動(dòng),如蛋白質(zhì)-DNA的相互作用。
具有14位垂直分辨率的信號(hào)發(fā)生器產(chǎn)生的亞皮牛頓(pN)精度的恒聲學(xué)力具有數(shù)小時(shí)的穩(wěn)定性和亞毫秒的響應(yīng)時(shí)間。
并行測量力學(xué)性能
AFS擁有強(qiáng)大獨(dú)特的功能,能夠以高度并行的方式實(shí)現(xiàn)單分子的測量。因?yàn)樵诤芏嗲闆r下由熱擾動(dòng)引起的復(fù)雜狀態(tài)及隨機(jī)的個(gè)別狀態(tài)需要在單個(gè)實(shí)驗(yàn)中同時(shí)測量得到,而AFS并行測量功能恰好實(shí)現(xiàn)了此要求,這是非常關(guān)鍵的。在這個(gè)單分子的拉力實(shí)驗(yàn)中,通過并行測量得到了20個(gè)DNA分子的力學(xué)參數(shù)。
力-拉伸長度曲線
20個(gè)獨(dú)立DNA分子的并行拉伸曲線。我們將張力從0.1 pN增加到48 pN來記錄力學(xué)-拉伸長度曲線。在一個(gè)可視區(qū)里同時(shí)并行地獲得曲線。單分子多數(shù)量力學(xué)測量功能,可以應(yīng)用到不同的實(shí)驗(yàn)如蛋白質(zhì)和RNA伸展和核酸酶處理。
高數(shù)據(jù)量的鍵斷裂測量
統(tǒng)計(jì)分析和高數(shù)據(jù)量采集對于抗體-抗原相互作用的表征是至關(guān)重要的。由于AFS多數(shù)量分子測試的能力,大量的鍵可以并行測試,大大減少了測量時(shí)間。
這個(gè)實(shí)驗(yàn)展示了AFS能夠在單個(gè)測量實(shí)驗(yàn)中獲取一個(gè)完整的251個(gè)單分子Dig:: anti-Dig鍵斷裂力分布。
斷裂力柱狀圖
251個(gè)Dig::anti-Dig鍵,拉伸載荷率為2.3 pN/s,每Dig::anti-Dig鍵的斷裂力記錄下來并繪制成一個(gè)斷裂力柱狀圖。此柱狀圖在相同條件下的單個(gè)實(shí)驗(yàn)中得到,保證實(shí)驗(yàn)的可靠性和重現(xiàn)性。AFS能夠應(yīng)用加載速率跨越幾個(gè)數(shù)量級(10-4 PN / s到103 PN / s),使之成為高度并行測量動(dòng)態(tài)力學(xué)譜的理想工具。
基于AFS技術(shù)的細(xì)胞操縱
AFS技術(shù)為科學(xué)家提供了來操縱任一物質(zhì)的****能力,與懸浮的液體介質(zhì)相比,密度不同。通過這個(gè)方法,力不僅可以作用于合成微球,也能作用于活體物質(zhì)本身。
在此,我們用AFS模塊施加力于神經(jīng)母細(xì)胞瘤細(xì)胞,并在商售的徠卡共焦顯微鏡(徠卡TCS SP8)下觀察。成像平面與聲學(xué)節(jié)點(diǎn)放置位置一致,大概在AFS芯片底部表面以上40微米左右。一旦啟用聲場,熒光標(biāo)記的細(xì)胞被迅速推離表面進(jìn)入到聲學(xué)節(jié)點(diǎn),并且呈現(xiàn)在成像平面。當(dāng)聲力停止時(shí),細(xì)胞由于重力原因下降,逐漸從熒光圖像中消失。
通過直接作用力于細(xì)胞這一能力,針對細(xì)胞生物學(xué)研究,AFS有非常大潛力,例如細(xì)胞粘附,細(xì)胞運(yùn)動(dòng)和細(xì)胞分化等研究。

測量RNA聚合酶活動(dòng)機(jī)制
AFS其自身功能多樣化和力穩(wěn)定性的設(shè)計(jì)使其成為研究DNA分子的活動(dòng)規(guī)律和機(jī)制的理想工具,涵蓋亞秒到小時(shí)的時(shí)間量程。RNA聚合酶的活動(dòng)通常具有復(fù)雜性:其正常工作機(jī)制往往被不同性質(zhì)的事件中斷。
在這個(gè)實(shí)驗(yàn)中,DNA分子和被處理過的大腸桿菌聚合酶復(fù)合被固定在AFS芯片表面。聚苯乙烯微球表面粘附能夠使DNA分子延伸的大腸桿菌RNA聚合酶。一旦開始轉(zhuǎn)錄和復(fù)制,通過實(shí)時(shí)測量DNA的延伸,能夠**檢測每個(gè)大腸桿菌聚合酶分子的活動(dòng),多個(gè)大腸桿菌RNA聚合酶的活動(dòng)機(jī)制在該試驗(yàn)中可以同時(shí)并行測量。如實(shí)驗(yàn)所示,RNA聚合酶延伸動(dòng)力學(xué)由于其運(yùn)動(dòng)機(jī)制常被出現(xiàn)的事件影響而體現(xiàn)出高度的隨機(jī)性,AFS作為一個(gè)有效的研究手段非常適合解決該問題。
AFS模塊
除了AFS單機(jī)顯微鏡平臺(tái),Lumicks公司還提供了AFS模塊,和商用的倒置光學(xué)顯微鏡連用。這個(gè)組合擁有非常強(qiáng)大的可視功能,使用戶能夠在**的熒光超分辨顯微鏡下研究生物分子及細(xì)胞的機(jī)械操縱。
AFS規(guī)格參數(shù)
AFS是一個(gè)真正的測量單分子的工具,包括一個(gè)專用的倒置光學(xué)顯微鏡,射流模塊和電子組件,集成在一個(gè)小箱體內(nèi)(300mm×375mm×200mm)。
AFS專用顯微鏡
單色LED照明
CFI消色差物鏡(可升級)
電動(dòng)Z軸物鏡臺(tái)(可升級)
USB 3.0 CMOS攝像頭(可升級)
手動(dòng)XY樣品臺(tái)
信號(hào)發(fā)生器(可升級)
AFS芯片
AFS系統(tǒng)包含三種AFS芯片,每個(gè)AFS芯片都會(huì)提前校準(zhǔn)并且給出芯片的共振頻率
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加載速率范圍:10-4 PN / s到103 PN / s
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AFS芯片尺寸:45 mm x 15 mm x 1.275 mm
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*大加載力:大于200 pN(4.5μm的聚苯乙烯微球,采用電壓放大器)
**的AFS芯片設(shè)計(jì)
我們將不斷地改進(jìn)AFS芯片。與AFS用戶密切合作,提高芯片的性能、功能和可用性。
AFS工作站及軟件(可升級)
AFS包括labview軟件包和一個(gè)強(qiáng)大的工作站。AFS軟件能夠?qū)崟r(shí)以納米級分辨率并行測試數(shù)以千計(jì)的微球。
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在25赫茲實(shí)時(shí)并行三維跟蹤60-300個(gè)微球
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在25赫茲實(shí)時(shí)并行二維跟蹤300-1500個(gè)微球
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在25赫茲實(shí)時(shí)跟蹤(X,Y)位置精度為2納米
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在25赫茲實(shí)時(shí)跟蹤(Z)位置精度為5納米
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通過參照微球的差值跟蹤進(jìn)行(Z)方向漂移較正
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自動(dòng)對照表校準(zhǔn)
AFS放大器(可選)
AFS的功能可通過一個(gè)電壓放大器擴(kuò)展。電壓增加,應(yīng)用與生物分子的*大加載力相應(yīng)增加。
放大器可以很容易通過后面板連接到AFS。AFS計(jì)算機(jī)已經(jīng)預(yù)裝所有相關(guān)的軟件和驅(qū)動(dòng)程序以適用于電壓放大器。